(удален) Разработка тест-системы для выявления и анализа лекарственной устойчивости возбудителей инфекционных заболеваний, приводящих к нарушениям репродуктивных функций.

Постановка задачи

Создание тест-системы для идентификации возбудителей инфекционных заболеваний\* с одновременным определением генетических детерминант резистентности к спектру антимикробных препаратов\**.

\**Streptococcus anginosus, Fusobacterium nucleatum, Staphylococcus epidermidis, Bacteroides fragilis, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Treponema pallidum, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis, Ureaplasma urealiticum, Enterococcus fecalis, Trichomonas vaginalis, Escherichia coli, Mobiluncus mulieris*

\*\**ципрофлоксацин, пенициллин, спектиномицин, цефтриаксон, доксициклин, метронидазол, азитромицин, тетрациклин*

**Бюджет:** индустриальный партнер должен вложить не менее 21,75 млн. собственных денежных средств в 2014-2016 гг.

Ожидаемый эффект

Тест-система позволит в течении 8 часов без стадии культивирования микроорганизмов идентифицировать ДНК возбудителей заболеваний, передающихся половым путем, и одновременно провести анализ мутаций, определяющих назначение персонализированной антибиотикотерапии.

**Поддержан:** Департамент научного проектирования Минздрава России

**Потенциальные индустриальные партнеры проекта**

- Холдинг ["ДНК-технологии"](http://www.dna-technology.ru/about/): более 350 сотрудников, в том числе, 7 докторов и 24 кандидата наук

Публикации

• Mckechnie, M.L., et al.,2009. Simultaneous Identification of 14 Genital Microorganisms in Urine by Use of a Multiplex PCR-Based Reverse Line Blot Assay. Journal of Clinical Microbiology. IF = 4.068.
• Kudinha, T., et al., 2012. Multiplex PCR-based reverse line blot assay for simultaneous detection of 22 virulence genes in uropathogenic Escherichia coli. Applied and environmental microbiology. IF = 4.406
• McIver, C.J., et al., 2009. Multiplex PCR testing detection of higher-than-expected rates of cervical mycoplasma, ureaplasma, and trichomonas and viral agent infections in sexually active australian women. Journal of Clinical Microbiology. IF = 4.068
• Mackay, I.M., et al., 2006. Detection and discrimination of herpes simplex viruses, Haemophilus ducreyi, Treponema pallidum, and Calymmatobacterium (Klebsiella) granulomatis from genital ulcers. Clinical infectious diseases. IF = 9.374
• Balashov, S., et al., 2013. Multiplex Bead Suspension Array for Screening Neisseria gonorrhoeae Antibiotic Resistance Genetic Determinants in Noncultured Clinical Samples. The Journal of Molecular Diagnostics. IF = 3.952

Средний импакт-фактор: 5.15

Кто может участвовать в конкурсе?

1) ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России. (Кубанов Алексей Алексеевич, д.б.н., зам. директора; средний IF = 2,7)

• Sokolovskiy E et al 2009. Guidelines for the laboratory diagnosis of syphilis in East European countries. // Sex Transm Infect. Aug;84(4):285-9. – IF 2.7
• Ilina EN et al 2009. Direct bacterial profiling by matrix-assisted laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry for identification of pathogenic Neisseria. // Journal of Molecular Diagnostics Jan;11(1):75-86. IF 3.95
• Domeika M et al 2009. Guidelines for the laboratory diagnosis of Chlamydia trachomatis infections in East European countries. // Journal of European Academy for Dermatology and Venereology. Dec; 23(12):1353-63. – IF 2.7
• Domeika M et al 2010 Guidelines for the laboratory diagnosis of trichomoniasis in East European countries. // Journal of European Academy for Dermatology and Venereology Oct;24(10):1125-34. – IF 2.7

Патенты:

• Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Сидоренко С.В., Нурутдинова О.С., Соломка В.С., Каганова Н.Л. Способ молекулярного типирования Сhlamydia trachomatis. Патент РФ 2378364. Приоритет от 23.10.2008. Опубликовано 10.01.2010

• Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Сидоренко С.В., Нурутдинова О.С., Буканов Н.А., Полевщикова С.А., Соломка В.С., Каганова Н.Л. Способ молекулярного типирования Neisseria gonorrhoeae. Патент РФ 2380408. Приоритет от 23.10.2008. Опубликовано 27.01.2010

• Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Китаева Н.В., Хайруллин Р.Ф., Фриго Н.В., Полетаева О.А., Лихарева В.В. Способ диагностики сифилиса с использованием метода прямого протеомного профилирования сыворотки крови. Патент РФ 2381505. Приоритет от 30.09.2008. Опубликовано 10.02.2010

• Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Галимов А.Р., Рахматулина М.Р., Шаталова А.Ю., Полевщикова С.А., Соломка В.С. ДНК-чип для комплексной идентификации условно-патогенных возбудителей урогенитальных инфекционных заболеваний. Патент РФ 109139. Приоритет от 06.04.2010. Опубликовано 10.10.2011

• Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Галимов А.Р., Кожушная Н.В., Полевщикова С.А., Ротанов С.В., Соломка В.С. ДНК-чип для комплексной идентификации облигатно-патогенных возбудителей инфекций, передаваемых половым путем. Патент РФ 109140. Приоритет от 06.04.2010. Опубликовано 10.10.2011.

• Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Лихарева В.В.,Нурутдинова О.С., Рахматулина М.Р., Шаталова А.Ю., Полевщикова С.А. ДНК-чип для комплексной диагностики инфекций, передаваемых половым путем. Патент РФ 117431. Приоритет от 05.11.2009. Опубликовано 27.06.2012.

2) ФГБУ "Научно-исследовательский институт физико-химической медицины ФМБА России" (Ильина Елена Николаевна, д.б.н., профессор, зав. Лабораторией молекулярной генетики микроорганизмов, средний импакт = 2.8)

• Elena N Ilina, Maya V Malakhova, Ivan N Bodoev, Nina Y Oparina, Alla V Filimonova, Vadim M Govorun. Mutation in ribosomal protein S5 leads to spectinomycin resistance in Neisseria gonorrhoeae. Frontiers in microbiology. 01/2013; 4:186. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23847609
• Kushnir AV, Ilina EN, Malakhova MV, Priputnevich TV, Filipenko ML. Multiple-locus variable number tandem repeat analysis of Neisseria gonorrhoeae isolates in Russia. Infect Genet Evol. 2012 Dec 19;14C:8. doi: 10.1016/j.meegid.2012.11.020 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23257414 IF = 3.0
• Shevchenko OV, Mudrak DY, Skleenova EY, Kozyreva VK, Ilina EN, Ikryannikova LN, Alexandrova IA, Sidorenko SV, Edelstein MV. First detection of VIM-4 metallo-β-lactamase-producing Escherichia coli in Russia. Clin Microbiol Infect. 2012 Jul;18(7):E214-7. doi: 10.1111/j.1469-0691.2012.03827.x. Epub 2012 Apr 4. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22487052 IF = 4.54
• Ikryannikova LN., Shkarupeta MM., Shitikov EA., Il’ina EN., Govorun VM. Comparative Evaluation of New Typing Schemes for Urogenital Chlamydia trachomatis Isolates. FEMS Immunol Med Microbiol. 2010, Jul 1;59(2):188-96 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20482629 IF = 2.44
• Elena N. Ilina, Nina Yu. Oparina, Egor A. Shitikov, Alexandra D. Borovskaya, and Vadim M. Govorun Molecular surveillance of clinical Neisseria gonorrhoeae isolates in Russia. Journal of Clinical Microbiology, 2010 Oct;48(10):3681-9 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20660213 IF = 4.15

Патент

• Лазарев В.Н., Шкарупета М.М., Левицкий С.А., Василевский А.А., Козлов С.А., Гришин Е.В., Говорун В.М. Способ ингибирования возбудителя хламидийной инфекции с использованием генов антимикробных пептидов паука Lachesana tarabaevi. Патент РФ 2468089. Приоритет от 07.10.2009

3) Другие коллективы (российские публикации)

• см. http://dna-technology.ru/information/fordoctors/diagnosticsippp/

Дополнительные материалы

1) Номер предложения(й): [№ 2492]( https://sstp.ru/fx/fcntp/ru.naumen.fcntp.components.jsp.published_jsp?uuid=corebofs000080000k6grfah252u5ask) 2) Проект Лота "05-04-03": [версия 2](https://drive.google.com/folderview?id=0B4qr4YB9sAfuSVlwOEVLMDBVVkk&usp=drive_web&tid=0B4qr4YB9sAfuNi1UdWotdlJSSU0)

Инициатор

Хайруллин Рафиль Фидаилевич [[адрес эл. почты скрыт]]

Ссылка