НЖ1.4к-18-01-04 Разработка модульных систем селективного обогащения нуклеиновых кислот для детекции клинически значимых маркеров методом высокопроизводительного секвенирования

Постановка задачи

Создание наборов реагентов, позволяющих с помощью высокопроизводительного секвенирования проводить диагностику генетических, онкологических, инфекционных, аутоиммунных заболеваний человека. Система наборов реагентов должна состоять из модулей, которые комбинируются друг с другом в зависимости от целей диагностики.

Структура проекта:

Проект 1.4. Разработка модульных систем селективного обогащения нуклеиновых кислот для детекции клинически значимых маркеров методом высокопроизводительного секвенирования

Проект 1.3. Разработка лабораторного регламента получения ДНК-библиотек для пренатальной неинвазивной диагностики и предимплантационного скрининга

Проект 1.3. Разработка лабораторного регламента получения ДНК-библиотек генов Т-клеточных рецепторов для анализа индивидуальных репертуаров Т лимфоцитов методом высокопроизводительного секвенирования

Проект 1.3. Определение в российской популяции полиморфных локусов нуклеиновых кислот у пациентов с высоким риском развития наследственных онкологических синдромов

Ожидаемый эффект

Технологии производства приборов и наборов расходных материалов для геномного секвенирования и синтеза генетических библиотек, соответствующие стандартам отрасли и доступные для российских потребителей, а также создание ИТ-инфраструктуры.

Публикации

  1. Neverov, A. D., Lezhnina, K. V., Kondrashov, A. S., Bazykin, G. A. (2014). Intrasubtype reassortments cause adaptive amino acid replacements in H3N2 influenza genes.PLoS genetics,10(1), e1004037. (impact factor: 8.17)
  2. Shugay, M., Britanova, O. V., Merzlyak, E. M. et al. (2014). Towards error-free profiling of immune repertoires.Nature methods,11(6), 653-655. (impact factor 25.953)
  3. Kuchenbaecker, K. B., Ramus, S. J. et al. (2015). Identification of six new susceptibility loci for invasive epithelial ovarian cancer.Nature genetics. (impact factor 29.648)

Кто может участвовать в конкурсе?

  1. ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора»
  2. ФГБУ Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова
  3. ФГБНУ Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова
  4. ФГБУ Научно-исследовательский институт урологии Минздрава России
  5. ФГБУН «Институт биоорганической химии им. академиков М.М Шемякина и Ю.А.Овчиникова»
  6. ФГБУ «НИИ онкологии им. Н.Н.Петрова» Минздрава России

Индустриальный партнер:

ООО «НекстБио», Москва

Дополнительные материалы

Инициатор

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора»

ФГБУ Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова

Ссылка

.

Предложите свои аргументы в пользу или против этого проекта

  • Один аргумент должен содержать один обосновывающий довод. Например, если Вас не устраивает (а) формулировка темы проекта, и (б) Вы считаете, что указанные публикации не имеют отношения к теме проекта, то это два отдельных аргумента «против».
  • Аргумент НЕ должен содержать: вопросы; мнение об аргументе другого участника; одобрение/неодобрение тематики по иным критериям, кроме того, что результаты можно опубликовать в высокорейтинговом журнале. Аргументы желательно подтверждать ссылками на статьи.

Аргументы ЗА 0

На данный момент аргументов нет

Аргументы ПРОТИВ 0

На данный момент аргументов нет