НЖ1.3-09-06-06 Получение антибактериальных веществ методом инвентаризации пептидома

Постановка задачи

Получить и охарактеризовать набор бактериоцинов, демонстрирующих антибактериальную активность широкого спектра действия и низкую цитотоксичность в отношении клеток животных. На основе полученных данных разработать комплект стандартных операционных процедур (СОП) для получения синтетических аналогов наиболее перспективных бактериоцинов.

Бюджет проекта на 2014-216 гг.: средства федерального бюджета - 45 000 тыс. руб., средства индустриального партнера - 30 000 тыс. руб. (40%). 

Ожидаемый эффект

В результате выполнения проекта будут созданы и полностью охарактеризованы 15 бактериоцинов, обладающих выраженной антибактериальной активностью и низкой цитотоксичностью, а в случае микобактериальной инфекции животных (M. bovis) – комплексов "бактериоцин-система доставки", успешно прошедших стадии испытаний, демонструрующие высокий потенциал при терапии бактериальных инфекций в модельных системах in vitro и in vivo. Будет разработана методика получения в промышленных масштабах синтетических бактериоцинов и их комплексов с системами доставки. Бактерицидная активность создаваемых препаратов будет проявляться при концентрации менее 0,1 мкг/мл.

Публикации

1. Carroll J, Draper LA, O'Connor PM, Coffey A, Hill C, Ross RP, Cotter PD, O'Mahony J. Comparison of the activities of the lantibiotics nisin and lacticin 3147 against clinically significant mycobacteria. Int J Antimicrob Agents. 2010 Aug;36(2):132-6. IF: 4,7

2. Carroll J, Field D, O'Connor PM, Cotter PD, Coffey A, Hill C, Ross RP, O'Mahony J.Gene encoded antimicrobial peptides, a template for the design of novel anti-mycobacterial drugs. Bioeng Bugs. 2010 Nov-Dec;1(6):408-12. IF: 3,9

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21468208

3. Carroll J, O' Mahony J. Anti-mycobacterial peptides: made to order with delivery included. Bioeng Bugs. 2011 Sep-Oct;2(5):241-6. IF: 4,3

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21876384

4.V. Sosunov, V. Mischenko, B. Eruslanov, E. Svetoch, Y.Shakina, N. Stern, K.Majorov, G. Sorokoumova, A. Selishcheva and A.Apt. Antimycobacterial activity of bacteriocins and their complexes with liposomes. J. Antimicrob. Chemoterapy, 2007, 59(5): 919-25. IF: 4,3

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17347179

Кто может участвовать в конкурсе?

Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии (ФБУН ГНЦ ПМБ), г. Оболенск

1.Svetoch EA, Eruslanov BV, Levchuk VP, Mitsevich EV, Mitsevich IP, Kovalev IuN, Fursova NK, Teĭmurazov MG, Stepanshin IuG, Volodina LI, Diatlov IA. антимикробная активность бактериоцина S760 продуцируемого Enterococcus faecium. Антибиотики и химиотерапия. 2011; 56:3-9. IF: 1,2

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21780664

2. Svetoch EA, Eruslanov BV, Levchuk VP, Perelygin VV, Mitsevich EV, Mitsevich IP, Stepanshin J, Dyatlov I, Seal BS, Stern NJ. Isolation of Lactobacillus salivarius 1077 (NRRL B-50053) and characterization of its bacteriocin, including the antimicrobial activity spectrum Appl Environ Microbiol. 2011 77:2749-54. IF: 2,3

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21378051

3. Svetoch EA, Eruslanov BV, Perelygin VV, Levchuk VP, Seal BS, Stern NJ Inducer bacteria, unique signal peptides, and low-nutrient media stimulate in vitro bacteriocin production by Lactobacillus spp. and Enterococcus spp. Strains. J Agric Food Chem. 2010 58:6033-8 IF: 2,7

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20429596

Средний IF: 2,1

ФГОУ ВПО "Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова", биологический факультет

1.Stoianova LG, Sul'timovs TD, Stroeva AR, Netrusov AI.  Microbiological characterization of a new strain of Lactacoccus lactis subsp. lactis K-205. Zh Mikrobiol Epidemiol Immunobiol. 2008 Jan-Feb; (1):60-3. IF:1,6

 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18368755

2. Ustiugova EA, Timofeeva AV, Stoianova LG, Netrusov AI, Katrukha GS. Characteristics and identification of bacteriocins prodused by Lactococcus lactis subsp. lactis 194-K. Prikl Biokhim Mikrobiol 2012 Nov-Dec; 48 (6):618-25. IF:1,4.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23330388

Средний IF: 1,5

ФГБУ "Институт биологии гена" РАН, г.Москва

1. Vondenhoff GH, Dubiley S, Severinov K, Lescrinier E, Rozenski J, Van Aerschot A. Extended targeting potential and improved synthesis of Microcin C analogs as antibacterials. Bioorg Med Chem. 2011 Sep 15;19(18):5462-7. IF: 3,4

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21855353

2. Severinov K, Nair SK. MicrocinC: biosynthesis and mechanisms of bacterial resistance.  Future Microbiol. 2012 Feb;7(2):281-9. IF: 3,2

http:www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22324995

3. Nocek B, Tikhonov A, Babningg G, Gu M, Zhou M, Makarova KS, Vonderhoff G, Van Aeroschot A, Kwon K, Anderson WF, Severinov K, Joachimiak A. Structural and functional characterization of microcin C resistance peptidase MccF from Bacillus anthracis. J Mol Biol. 2012 Jul 20; 420(4-5):366-83. IF:3,0

http:www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22516613

Средний IF: 3,2

ФГБУ "НИИ вакцин и сыворотоким. И.И. Мечникова" РАМН, г.Москва

1. Blinkova LP, Al'tshuler ML, Dorofeeva ES, Gorobets OB. Мolecular basis of bacteriocins production and activity. Zh Mikrobiol Epidemiol Immunobiol. 2007. Mar-Apr;(2):97-104. IF:2,2

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17523491

2. Mashentseva NG, Khorol'skiĭ VV, Blinkova LP, Baranova EA, Gorbatko ES, Laptev IA. Study of genetic control of pediocins synthesis. Zh Mikrobiol Epidemiol Immunobiol. 2008 Nov-Dec;(6):3-6.IF: 1,8

Средний IF:2,0.

Дополнительные материалы

1) Системный номер: 2014-03-03-21605,регистрационный номер - 3740.

2) Проект лота

2) Аннотация

3) Презентация

4) Мини-презентация для НКС (1 слайд)

Инициатор

Общество с ограниченной ответственностью “ДНК-Синтез”, Сосунов Василий Валерьевич, [[адрес эл. почты скрыт]], тел. (495)998-6402

Ссылка

www.oligos.ru

Предложите свои аргументы в пользу или против этого проекта

  • Один аргумент должен содержать один обосновывающий довод. Например, если Вас не устраивает (а) формулировка темы проекта, и (б) Вы считаете, что указанные публикации не имеют отношения к теме проекта, то это два отдельных аргумента «против».
  • Аргумент НЕ должен содержать: вопросы; мнение об аргументе другого участника; одобрение/неодобрение тематики по иным критериям, кроме того, что результаты можно опубликовать в высокорейтинговом журнале. Аргументы желательно подтверждать ссылками на статьи.

Аргументы ЗА 0

На данный момент аргументов нет

Аргументы ПРОТИВ 0

На данный момент аргументов нет