НЖ1.3-05-04-01 Разработка панели маркеров, ассоциированных с ранними этапами злокачественной трансформации предстательной железы.
Постановка задачи
Ожидаемый эффект
Публикации
Rebecca A. Burrell et al. (2013) The causes and consequences of genetic heterogeneity in cancer evolution // Nature (IF 38.597)
Alexandrov, L. B. et al. (2013), Signatures of mutational processes in human cancer, // Nature (IF 38.597)
Sreekumar, A. et al. (2013) Metabolomic profiles delineate potential role for sarcosine in prostate cancer progression // Nature (IF 38.597)
Yang, L. et al. (2013) lncRNA-dependent mechanisms of androgen-receptor-regulated gene activation programs // Nature (IF 38.597)
Средний импакт-фактор: 38.597
Кто может участвовать в конкурсе?
1) НИИ физико-химической медицины ФМБА России (геномика, протеомика, клеточная биология и биоинформатика, научный лидер – Говорун В.М., д.б.н., профессор, заведующий лабораторией протеомного анализа)
Tyakht AV, Kostryukova ES, Popenko AS, Belenikin MS, Pavlenko AV, et al. (2013) Human gut microbiota community structures in urban and rural populations in Russia // Nature Communications (IF 10.0)
Naumov, Vladimir A., et al. (2013) Genome-scale analysis of DNA methylation in colorectal cancer using Infinium HumanMethylation450 BeadChips // Epigenetics (IF 4.6)
Ziganshin, R., Arapidi, G., Azarkin, I., Zaryadieva, E., Alexeev, D., Govorun, V., & Ivanov, V. (2011). New method for peptide desorption from abundant blood proteins for plasma/serum peptidome analyses by mass spectrometry. Journal of Proteomics, 74(5), 595–606. (IF = 4.088)
Средний импакт фактор: 6.23
2) Центр «Биоинженерия» РАН (задел в области геномики злокачественных образований, научный лидер – Прохорчук Е.Б., д.б.н., зав. лаб. геномики и эпигеномики позвоночных)
Wu X., Prokhortchouk E., Zaridze D., Skryabin K.G. et al. (2012) A genome-wide association study identifies a novel susceptibility locus for renal cell carcinoma on 12p11.23 // Human Molecular Genetics (IF 7.69)
Purdue M.P., Prokhortchouk E., Zaridze D., Matveev V., Skryabin K.G. et al. (2011) Genome-wide association study of renal cell carcinoma identifies two susceptibility loci on 2p21 and 11q13.3 // Nature Genetics (IF 35.21)
McFarland, C.D., Korolev, K.S., Kryukov, G.V., Sunyaev, S.R., and Mirny, L.A. (2013) Impact of deleterious passenger mutations on cancer progression // Proceedings of the National Academy of Sciences *IF 9.7)
Chekanov, N. N., et al. (2010) Individual Genome of the Russian Male: SNP Calling and a de novo Assembly of Unmapped Reads // Acta naturae (IF 0.477)
Hudson T. J. et al. (2010) International network of cancer genome projects // Nature (IF 38.5)
Skryabin K. G. et al. (2009) Combining two technologies for full genome sequencing of human //Acta naturae (IF 0.477)
Средний импакт фактор: 18.31
3) МГУ им. М.В.Ломоносова (геномика злокачественных заболеваний и исследования соматических мутаций ракового генома, научный лидер – Кондрашов А.C., к.б.н., профессор, зав. лаб. эволюционной геномики, средний импакт фактор: 17.0)
Adzhubei Ivan A., et al. (2010) A method and server for predicting damaging missense mutations // Nature methods (IF 23.565)
Flegontov P, Votýpka J, Skalický T, Logacheva MD, Penin AA, Tanifuji G, Onodera NT, Kondrashov AS, Volf P, Archibald JM, Lukeš J. (2012) Paratrypanosoma is a novel early-branching trypanosomatid // Current Biology (IF 10.445)
Средний импакт фактор по стране: 14.43
Дополнительные материалы
Инициатор
Ссылка
Предложите свои аргументы в пользу или против этого проекта
- Один аргумент должен содержать один обосновывающий довод. Например, если Вас не устраивает (а) формулировка темы проекта, и (б) Вы считаете, что указанные публикации не имеют отношения к теме проекта, то это два отдельных аргумента «против».
- Аргумент НЕ должен содержать: вопросы; мнение об аргументе другого участника; одобрение/неодобрение тематики по иным критериям, кроме того, что результаты можно опубликовать в высокорейтинговом журнале. Аргументы желательно подтверждать ссылками на статьи.