НЖ1.3-05-04-03 Разработка тест-системы для выявления и анализа лекарственной устойчивости инфекционных агентов, приводящих к нарушениям репродуктивных функций

Постановка задачи

Создание тест-системы для идентификации нарушающих репродуктивную функцию инфекционных возбудителей с одновременным определением генетических детерминант резистентности к антимикробным препаратам с целью назначения адекватной персонализированной терапии. Тест-система должна обеспечивать идентификацию не менее 15 возбудителей инфекционных заболеваний\* с одновременным определением не менее 30 генетических детерминант устойчивости к 8 различным классам\** антимикробных препаратов. Тест-система должна быть основана на методе определения последовательностей нуклеиновых кислот, обеспечивающем анализ не менее 50 биологических образцов за рабочую смену (8 часов). \**Streptococcus anginosus, Fusobacterium nucleatum, Staphylococcus epidermidis, Bacteroides fragilis, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Treponema pallidum, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis, Ureaplasma urealiticum, Enterococcus fecalis, Trichomonas vaginalis, Escherichia coli, Mobiluncus mulieris* \*\**ципрофлоксацин, пенициллин, спектиномицин, цефтриаксон, доксициклин, метронидазол, азитромицин, тетрациклин* **Бюджет**: индустриальный партнер должен вложить не менее 21,25 млн. собственных денежных средств в 2014-2016 гг. (20% от общей стоимости проекта)

Ожидаемый эффект

**Оценка потребности в РФ:** не менее 120 лабораторий учреждений дерматовенерологического профиля РФ в 2018-2020 г., до 200 лабораторий к 2021 году. **Поддержан**: Департамент научного проектирования Минздрава России **Потенциальные индустриальные партнеры проекта** - [Холдинг "ДНК-технологии"](http://www.dna-technology.ru/about): более 350 сотрудников, в том числе, 7 докторов и 24 кандидата наук - [ООО "БИОЧИП-ИМБ"](http://www.biochip-imb.ru): лидер российского рынка в области разработки и производства и коммерциализации биочипов для диагностики, 15 чел. (инженеры и научный персонал)

Кто может участвовать в конкурсе?

1) ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России. (Кубанов Алексей Алексеевич, д.б.н., зам. директора; средний IF = 2,7)

Патенты:

  • Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Сидоренко С.В., Нурутдинова О.С., Соломка В.С., Каганова Н.Л. Способ молекулярного типирования Сhlamydia trachomatis. Патент РФ 2378364. Приоритет от 23.10.2008. Опубликовано 10.01.2010

  • Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Сидоренко С.В., Нурутдинова О.С., Буканов Н.А., Полевщикова С.А., Соломка В.С., Каганова Н.Л. Способ молекулярного типирования Neisseria gonorrhoeae. Патент РФ 2380408. Приоритет от 23.10.2008. Опубликовано 27.01.2010

  • Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Китаева Н.В., Хайруллин Р.Ф., Фриго Н.В., Полетаева О.А., Лихарева В.В. Способ диагностики сифилиса с использованием метода прямого протеомного профилирования сыворотки крови. Патент РФ 2381505. Приоритет от 30.09.2008. Опубликовано 10.02.2010

  • Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Галимов А.Р., Рахматулина М.Р., Шаталова А.Ю., Полевщикова С.А., Соломка В.С. ДНК-чип для комплексной идентификации условно-патогенных возбудителей урогенитальных инфекционных заболеваний. Патент РФ 109139. Приоритет от 06.04.2010. Опубликовано 10.10.2011

  • Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Галимов А.Р., Кожушная Н.В., Полевщикова С.А., Ротанов С.В., Соломка В.С. ДНК-чип для комплексной идентификации облигатно-патогенных возбудителей инфекций, передаваемых половым путем. Патент РФ 109140. Приоритет от 06.04.2010. Опубликовано 10.10.2011.

  • Кубанова А.А., Кубанов А.А, Лесная И.Н., Фриго Н.В., Лихарева В.В.,Нурутдинова О.С., Рахматулина М.Р., Шаталова А.Ю., Полевщикова С.А. ДНК-чип для комплексной диагностики инфекций, передаваемых половым путем. Патент РФ 117431. Приоритет от 05.11.2009. Опубликовано 27.06.2012.

2) ФГБУ "Научно-исследовательский институт физико-химической медицины ФМБА России" (Ильина Елена Николаевна, д.б.н., профессор, зав. лабораторией молекулярной генетики микроорганизмов, средний импакт = 2.8)

Патент

  • Лазарев В.Н., Шкарупета М.М., Левицкий С.А., Василевский А.А., Козлов С.А., Гришин Е.В., Говорун В.М. Способ ингибирования возбудителя хламидийной инфекции с использованием генов антимикробных пептидов паука Lachesana tarabaevi. Патент РФ 2468089. Приоритет от 07.10.2009

3) ФГБУ "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Шипулин Герман Александрович, д.б.н., заведующий Отделом молекулярной диагностики и эпидемиологии, средний импакт = 1.99)

Патенты

  • Маркелов М.Л., Чеканова Т.А., Шипулин Г.А. Диагностическая тест-система в формате иммуночипа и способ серологической дифференциальной диагностики сифилиса. Патент РФ 2397178. Приоритет от 27.02.2009
  • Усольцева О.С., Шипулин Г.А., Гущин А.Е., Котловский Ю.В., Воеводина Т.В. Способ диагностики трихомониаза. Патент РФ 2389016. Приоритет от 07.07.2008
  • Мазепа В.Н., Шипулин Г.А., Бруснигина Н.Ф., Черневская О.М., Орлова К.А., Махова М,А, Скобло Л.Е, Сперанская Е.В., Кленина Н.Н. Способ выявления наиболее значимых возбудителей негонококковых урогенитальных инфекций (Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Сytomegalovirus, Herpes symplex I/II) у детей с использованием метода ПЦР. Патент РФ 2271003. Приоритет от 03.11.2003

4) Другие коллективы (российские публикации)

Средний импакт по стране -- 2.5

Дополнительные материалы

1) Номер предложения: [№ 2492]( https://sstp.ru/fx/fcntp/ru.naumen.fcntp.components.jsp.published_jsp?uuid=corebofs000080000k6grfah252u5ask) 2) Проект Лота: [версия 1](https://drive.google.com/folderview?id=0B4qr4YB9sAfuNDRzZFZFNmdvUW8&usp=drive_web), [версия 2 от 13 марта 2014 г.] (https://drive.google.com/folderview?id=0B4qr4YB9sAfucmIzRDk0N2RYV0k&usp=drive_web) // [в повестке НКС](https://sstp.ru/fx/fcntp/ru.naumen.fcntp.components.jsp.published_jsp?uuid=corebofs000080000k887tc3hhiknsg0) [версия 2 от 14 марта 2014 г.] (https://drive.google.com/folderview?id=0B4qr4YB9sAfucmIzRDk0N2RYV0k&usp=drive_web) 3) Примеры разработки и внедрения тест-систем для диагностики и персонализированной медицины на основе технологии биочипов: - ["Чип-успехи российских учёных."](http://www.strf.ru/material.aspx?CatalogId=221&d_no=74328#.Uya9DYWXTHI) [S&TRF.Наука и технологии России](www.strf.ru). 05.02.2014 - ["В Институте молекулярной биологии РАН создали биочип для определения аллергии"](http://lifenews.ru/news/128500) [L!FE NEWS](http://lifenews.ru/).06.03.2014

Инициатор

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России. Хайруллин Рафиль Фидаилевич, Заведующий Отделением микробиологических методов диагностики возбудителей ИППП и заболеваний кожи, [[адрес эл. почты скрыт]]

Ссылка

--

Предложите свои аргументы в пользу или против этого проекта

  • Один аргумент должен содержать один обосновывающий довод. Например, если Вас не устраивает (а) формулировка темы проекта, и (б) Вы считаете, что указанные публикации не имеют отношения к теме проекта, то это два отдельных аргумента «против».
  • Аргумент НЕ должен содержать: вопросы; мнение об аргументе другого участника; одобрение/неодобрение тематики по иным критериям, кроме того, что результаты можно опубликовать в высокорейтинговом журнале. Аргументы желательно подтверждать ссылками на статьи.

Аргументы ЗА 0

На данный момент аргументов нет

Аргументы ПРОТИВ 1

Сергей Викторович Балашов привeл аргумент 05.01.16 20:24

Считаю цель проекта НЖ1.3-05-04-03 нереализуемой. Как эксперт и разработчик промышлленных диагностических систем в США, считаю, что разработка заявленной тест системы как отдельно взятого коммерческого продукта будет связана с непреодолимыми техническими, научными и организационными трудностями.