НЖ 1.3-04-04-01 Разработка регламента и программного обеспечения для сравнительного анализа индивидуальных репертуаров Т-клеточных рецепторов.

Постановка задачи

Разработать метод сравнительного анализа индивидуального набора вариантов Т-клеточных рецепторов человека, включающий пробоподготовку, массированное чтение геномов и сравнительный анализ данных, и предназначенный для повышения эффективности существующих методов выявления и коррекции аутоиммунных, онкологических, и инфекционных патологий.

Разработать метод сравнительного анализа индивидуального набора вариантов Т-клеточных рецепторов человека, включающий пробоподготовку, массированное чтение геномов и сравнительный анализ данных, и предназначенный для повышения эффективности существующих методов выявления и коррекции аутоиммунных, онкологических, и инфекционных патологий.

Должны быть получены данные по индивидуальным репертуарам нуклеотидных последовательностей гипер-вариабельных участков Т-клеточных рецепторов не менее чем для 300 образцов. Результаты должны быть доступны в сети Интернет в составе пополняемой базы данных по индивидуальным репертуарам Т-клеточных рецепторов.

**Бюджет:** Для получения бюджетного софинансирования индустриальный партнер должен вложить в реализацию проекта не менее 13,75 млн. руб. в виде средств нераспределенной прибыли или заемных денежных средств.

**Сроки выполнения:** 2014-2016 гг.

Ожидаемый эффект

Будет разработана технология подготовки кДНК-библиотек генов Т-клеточных рецепторов и программное обеспечение для анализа данных массированного секвенирования библиотек генов Т-клеточных рецепторов.

**Потенциальные индустриальные партнеры проекта:**

- ЗАО "Евроген Ай Пи" (г. Москва), проектная компания [ЗАО "Евроген"](http://www.evrogen.ru/)

- Биомедицинский холдинг "Атлас" -- центр персонализированной медицины Atlas Medical Center (г. Москва), см. статью

Публикации

средний уровень исследований за рубежом: IF 20.88

Кто может участвовать в конкурсе?

1) Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (группа проф. Д. Чудакова, средний IF 14.1)

2) Российский онкологический научный центр им. Н. Н. Блохина (средний IF 1.5):

3) Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН (средний IF 3.8):

средний уровень исследований в стране: IF 10.0

Дополнительные материалы

1) В России разработан оригинальный программный продукт -- см. [http://mitcr.milaboratory.com/](http://mitcr.milaboratory.com/) 2) Проект Лота "04-04-01": [версия 2](https://drive.google.com/folderview?id=0B4qr4YB9sAfuTkFzeTUwR0ZOeVk&usp=drive_web&tid=0B4qr4YB9sAfuNi1UdWotdlJSSU0), [версия 3] (https://drive.google.com/file/d/0B4qr4YB9sAfuV25lejlieVk3SlU/edit?usp=sharing) 3) Номер Предложения: [№ 2175]( https://sstp.ru/fx/fcntp/ru.naumen.fcntp.components.jsp.published_jsp?uuid=corebofs000080000k62np75aedqtq5o)

Инициатор

Чудаков Дмитрий Михайлович [[адрес эл. почты скрыт]]

Ссылка

-

Предложите свои аргументы в пользу или против этого проекта

  • Один аргумент должен содержать один обосновывающий довод. Например, если Вас не устраивает (а) формулировка темы проекта, и (б) Вы считаете, что указанные публикации не имеют отношения к теме проекта, то это два отдельных аргумента «против».
  • Аргумент НЕ должен содержать: вопросы; мнение об аргументе другого участника; одобрение/неодобрение тематики по иным критериям, кроме того, что результаты можно опубликовать в высокорейтинговом журнале. Аргументы желательно подтверждать ссылками на статьи.

Аргументы ЗА 0

На данный момент аргументов нет

Аргументы ПРОТИВ 0

На данный момент аргументов нет