НЖ1.2-07-05-01 Разработка регламента детекции и маркирования новых генов устойчивости к фитопатогенам у пшеницы на основе геномного секвенирования

Постановка задачи

Разработка молекулярных маркеров для проведения маркер-опосредованной селекции по генам, определяющим хозяйственно-ценные признаки, и для высокопроизводительного генотипирования культивируемых видов пшеницы

Количество проектов: 2
Бюджет одного проекта: 21 млн.руб. + 20% внебюджетные средства

Ожидаемый эффект

Краткие результаты прикладного научного исследования:

- нуклеотидная последовательность ДНК районов хромосом пшеницы, насыщенных генами устойчивости к фитопатогенам;

- банк данных по предполагаемым генам устойчивости к фитопатогенам и маркерам к ним;

- будут выявлены структурные и функциональные отличия аллелей генов устойчивости при анализе селекционного или коллекционном материале пшеницы, различающегося по устойчивости к фитопатогенам;

- молекулярные маркеры для проведения маркер-опосредованной селекции по генам, определяющим устойчивость к фитопатогенам, и для высокопроизводительного генотипирования культивируемых видов растений;

- доступная для селекционеров тест-система для идентификации генов устойчивости к фитопатогенам пшеницы.

Научно-технический уровень ожидаемых результатов:

Референсная нуклеотидная последовательность ДНК районов хромосом пшеницы будет определена в соответствии с международными стандартами. Все остальные полученные результаты будут превышать мировые аналоги. Новизна работы базируется на том, что все известные маркеры к генам устойчивости к фитопатогенам у пшеницы получены за рубежом и на их селекционном материале. Число новых генов устойчивости к фитопатогенам и маркеров к ним будет увеличено не менее чем на 30% от известных мировых аналогов. Основное отличие от мировых аналогов будет состоять в том, что эти гены будут обеспечивать защиту сортов Российской Федерации. Будет расширена база данных по последовательностям ДНК предполагаемых генов устойчивости не менее чем на 20 генов/аллелей, будет расширена база данных по различным молекулярным маркерам пшеницы (SNP, ISBP, SSR) не менее чем на 1000. Разработанная тест-система для новых и известных генов устойчивости позволит эффективно генотипировать линии и сорта пшеницы, выращиваемые в Российской Федерации.

Публикации

[1]. Ariyadasa R. et al. (2014) A sequence-ready physical map of barley anchored genetically by two million single-nucleotide polymorphisms // Plant Physiology -- IF 7.1

[2]. Takagi H, et al. (2013) QTL-seq: rapid mapping of quantitative trait loci in rice by whole genome resequencing of DNA from two bulked populations // The Plant Journal -- IF 6.6

[3]. Schnable P.S. et al. (2009) The B73 maize genome: complexity, diversity, and dynamics // Science -- IF 31.0

[4]. Raats D. et al. (2013) The physical map of wheat chromosome 1BS provides insights into its gene space organization and evolution // Genome Biology -- IF 10.3

* средний уровень исследований за рубежом: IF 13.75

Кто может участвовать в конкурсе?

Институт цитологии и генетики СО РАН, участник консорциума по расшифровке генома пшеницы

Центр«Биоинженерия» РАН, опыт работ по расшифровке геномов растений, в т.ч. картофеля (Nature, 2011) и разработке молекулярных маркеров

Биологический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова, одна из ведущих организаций в РФ в области генетики растений

Институт общей генетики им. Н.И Вавилова РАН

Дополнительные материалы

1) на основе Предложений №154№1871№1781(1.3)№1935
2) материалы: краткое описание, оценка, слайд
3) на основе http://rgls.wikivote.ru/fcp-event-1-2-1/card-22987

Инициатор

Институт цитологии и генетики СО РАН,  Елена Салина, [[адрес эл. почты скрыт]]

Ссылка

..

Предложите свои аргументы в пользу или против этого проекта

  • Один аргумент должен содержать один обосновывающий довод. Например, если Вас не устраивает (а) формулировка темы проекта, и (б) Вы считаете, что указанные публикации не имеют отношения к теме проекта, то это два отдельных аргумента «против».
  • Аргумент НЕ должен содержать: вопросы; мнение об аргументе другого участника; одобрение/неодобрение тематики по иным критериям, кроме того, что результаты можно опубликовать в высокорейтинговом журнале. Аргументы желательно подтверждать ссылками на статьи.

Аргументы ЗА 0

На данный момент аргументов нет

Аргументы ПРОТИВ 0

На данный момент аргументов нет