НЖ1.2-02-03-09 Синтетическая геномика: конструирование метаболических путей в промышленно-значимых микроорганизмах

Постановка задачи

Должны быть сконструированы рекомбинантные штаммы промышленно значимых микроорганизмов (бактерий, грибов, архей) на основе направленного изменения путей метаболизма клетки, в том числе, путем создания новых для данного организма биосинтетических путей. Мишенями для направленного изменения могут являться центральные метаболические пути (метаболизм жирных кислот, биосинтез антибиотиков, изопреноидов, пентозофосфатный цикл, цикл трикарбоновых кислот). Исполнителям предлагается осуществить конструирование рекомбинантных штаммов за счет инактивации и введения новых генов, изменения уровня экспрессии генов или изменения аминокислотной последовательности их продуктов.

На один проект из средств федерального бюджета выделяется не менее 15 млн. руб. и не более 18 млн. руб. Не менее 10% от общей стоимости проекта должно обеспечиваться собственными или привлеченными денежными средствами (от 1,7 млн. до 2 млн. руб.).

**Будет поддержано не менее 3 проектов.**

Ожидаемый эффект

Выполнение каждого проекта должно обеспечить не менее 3 публикаций в международных научных журналах со средним импакт-фактором не менее 2 и получение как минимум одного патента на изобретение. В результате выполнения каждого из проектов должны быть получены рекомбинантные штаммы – продуценты промышленно значимых или физиологически активных веществ с высоким рыночным потенциалом.

Публикации

  • Alonso-Gutierrez J, Chan R, Batth TS, Adams PD, Keasling JD, Petzold CJ, Lee TS. (2013) Metabolic engineering of Escherichia coli for limonene and perillyl alcohol production. Metab Eng. 19: 33-41. – IF 6,86
  • Chou HH, Keasling JD. (2012) [Synthetic pathway for production of five-carbon alcohols from isopentenyl diphosphate. Appl Environ Microbiol. 78(22): 7849-7855. – IF 3,68
  • Park J, Rodríguez-Moyá M, Li M, Pichersky E, San KY, Gonzalez R. (2012) [Synthesis of methyl ketones by metabolically engineered Escherichia coli. J Ind Microbiol Biotechnol. 39(11): 1703-1712. – IF 2,32
  • Machado HB, Dekishima Y, Luo H, Lan EI, Liao JC. (2012) [A selection platform for carbon chain elongation using the CoA-dependent pathway to produce linear higher alcohols. Metab Eng. 14(5): 504-511. – IF 6,86
  • Du J, Shao Z, Zhao H. (2011) [Engineering microbial factories for synthesis of value-added products. J Ind Microbiol Biotechnol. 38(8): 873-890. – IF 2,32

  • средний уровень исследований за рубежом: IF 4,4

Кто может участвовать в конкурсе?

1) Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН (группа И.Г. Моргунова: микробиология, биохимия и физиология микроорганизмов, культивирование микроорганизмов)

2) ФГУП Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов (ГосНИИгенетика) (группа В.Г. Дебабова: микробиология и биохимия, генетическая инженерия, рекомбинантные продуценты метаболитов)

3) Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика (группа С.В. Машко: микробиология, генетическая инженерия, рекомбинантные продуценты метаболитов)

4) Институт биохимии РАН (группа Н.В. Карапетяна, группа С. В. Беневоленского: биохимия, клеточный метаболизм, генетическая инженерия)

5) Московский Государственный Университет им. М.В. Ломоносова (группа А.И. Нетрусова, группа В.И. Тишкова: энзимология, биохимия и физиология микроорганизмов, клеточный метаболизм, культивирование микроорганизмов)

средний уровень исследований в стране: IF 2,73

Дополнительные материалы

1) Проект Лота "02-03-09": [версия 2](https://drive.google.com/?tab=mo&authuser=0#folders/0B4qr4YB9sAfuc0RxUW45MVlmS1E)

2) Номер предложения(й): [№: 1060](https://sstp.ru/fx/fcntp/ru.naumen.fcntp.components.jsp.published_jsp?uuid=corebofs000080000k4rs09eid69ib18)

Инициатор

Равин Н.В. [[адрес эл. почты скрыт]]

Ссылка

нет

Предложите свои аргументы в пользу или против этого проекта

  • Один аргумент должен содержать один обосновывающий довод. Например, если Вас не устраивает (а) формулировка темы проекта, и (б) Вы считаете, что указанные публикации не имеют отношения к теме проекта, то это два отдельных аргумента «против».
  • Аргумент НЕ должен содержать: вопросы; мнение об аргументе другого участника; одобрение/неодобрение тематики по иным критериям, кроме того, что результаты можно опубликовать в высокорейтинговом журнале. Аргументы желательно подтверждать ссылками на статьи.

Аргументы ЗА 0

На данный момент аргументов нет

Аргументы ПРОТИВ 0

На данный момент аргументов нет