Постановка задачи

Исследования должны быть направлены на разработку геномных, транскриптомных, протеомных и иммуногенетических подходов для раскрытия молекулярных механизмов патогенеза аутоиммунных воспалительных демиелинизирующих заболеваний. Исполнителям предлагается создать высокорепрезентативные библиотеки генов иммуноглобулинов больных и путем секвенирования выявить генетические репертуары В-клеток, синтезирующих специфические и перекрестно реагирующие антитела к аутоантигенам исследуемых заболеваний и к триггерным антигенам вирусов или бактерий. Предлагается провести анализ генетических ассоциаций и экзомное секвенирование, полное транскрипционное профилирование и протеомно-пептидомное картирование для выявления ДНК-, РНК- и белковых маркеров заболевания и ответа на терапию, Полученные результаты должны характеризовать общность и различия в этиологии и патогенезе аутоиммунных воспалительных демиелинизирующих заболеваний центральной и периферической нервной системы. На один проект из средств федерального бюджета выделяется 15 млн. руб. Не менее 10% от общей стоимости проекта должно обеспечиваться собственными или привлеченными денежными средствами (от 1,67 млн. руб.). **Будет поддержано не менее 4 проектов.**

Ожидаемый эффект

Выполнение каждого проекта должно обеспечить не менее 5 публикаций в международных научных журналах с импакт-фактором выше 3. Должны быть выявлены биомаркеры для дифференциальной диагностики, персонализации лечения и прогноза характера течения исследуемых заболеваний: рассеянный склероз, хроническая воспалительная демиелинизирующая полинейропатия, синдром Гийена-Барре.

Публикации

• Pascual V., Chaussabel D., Jacques Banchereau J., 2010. A Genomic Approach to Human Autoimmune Diseases.// Annu Rev Immunol. 28:535–571. IF 49.271.
• Compston A, Coles A. 2008. Multiple sclerosis.// Lancet. 2008; 372:1502–1517. IF 36.427

• Köller H., et al., 2005.Chronic Inflammatory Demyelinating Polyneuropathy.// N Engl J Med; 352:1343-1356; IF 51.658

• Israeli E. et al., 2012. Guillain-Barré syndrome--a classical autoimmune disease triggered by infection or vaccination.// Clin Rev Allergy Immunol; 42(2):121-30; IF 5.59

• Kawamura N et al., 2013.Anti-neurofascin antibody in patients with combined central and peripheral demyelination.// Neurology. 81(8):714-22. IF 8.25

• S. Sawcer et al., 2011. Genetic risk and a primary role for cell-mediated immune mechanisms in multiple sclerosis.// Nature. 476(7359): 214–219. IF 38.597

• Lehmann HC, Kieseier BC., 2009. Predicting treatment responses to IV immunoglobulins: can we already ask the genes?// Neurology.;73(17):1344-5;IF 8.25

средний уровень исследований за рубежом: IF 28,2

Кто может участвовать в конкурсе?

1) Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской Федерации (средний IF 15.7) (группа Фаворовой О.О.)

• Comi G. et al. Placebo-controlled trial of oral laquinimod for multiple sclerosis.// N Engl J Med, 2012, 366(11): 1000-1009. IF – 51.658

• Tsareva E.Y. et al. Allelic combinations of immune-response genes associated with glatiramer acetate treatment response in Russian multiple sclerosis patients.// Pharmacogenomics. 2012; 13 (1): 43-53. IF – 3.857

• Kulakova O.G. et al. Allelic combinations of immune-response genes as possible composite markers of IFN-β efficacy in multiple sclerosis patients.// Pharmacogenomics. 2012; 13(15): 1689-1700. IF – 3.857

• Rieckmann P. et al. Future MS care: a consensus statement of the MS in the 21st Century Steering Group.// J Neurol. 2013, 260 (2): 462-469. IF – 3.578.

2) Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Научно-исследовательский институт физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства России (средний IF 9.2) (группа Говоруна В.М.)

• Tyakht A.V. et al. Human gut microbiota community structures in urban and rural populations in Russia.// Nat Commun. 2013;4:2469. IF – 10.015.

• Reshetnyak A.V. Routes to covalent catalysis by reactive selection for nascent protein nucleophiles.// J Am Chem Soc. 2007; 129(51):16175-82. IF – 7.89

• Ponomarenko N.A. Autoantibodies to myelin basic protein catalyze site-specific degradation of their antigen.// Proc Natl Acad Sci U S A. 2006: (2):281-6. IF – 9.64

3) Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (средний IF 6.7) (группа А.Г. Габибова)

• Gabibov A.G. et al. Combinatorial antibody library from multiple sclerosis patients reveals antibodies that cross-react with myelin basic protein and EBV antigen.// FASEB J. 2011; 25(12):4211-21. IF – 5.7

• Belogurov A.A. Jr et al. Liposome-encapsulated peptides protect against experimental allergic encephalitis.// FASEB J. 2013; 27(1):222-31. IF –5.7

• Smirnov I. et al. Reactibodies generated by kinetic selection couple chemical reactivity with favorable protein dynamics.// Proc Natl Acad Sci U S A. 2011; 108(38):15954-9. IF – 9.737.

• Belogurov AA Jr, Kurkova IN, Friboulet A, Thomas D, Misikov VK, Zakharova MY, Suchkov SV, Kotov SV, Alehin AI, Avalle B, Souslova EA, Morse HC 3rd, Gabibov AG, Ponomarenko Recognition and degradation of myelin basic protein peptides by serum autoantibodies: novel biomarker for multiple sclerosis. // NA.J Immunol. 2008, 180(2):1258-67. IF – 5.52

4) Институт цитологии и генетики СО РАН / НГУ (средний IF 19.6) (группа Ю.С. Аульченко)

• Svishcheva GR, Axenovich TI, Belonogova NM, van Duijn CM, Aulchenko YS. Rapid variance components-based method for whole-genome association analysis. Nat Genet. 2012t; 44(10):1166-70. IF=35

• Belonogova NM, Axenovich TI, Aulchenko YS. A powerful genome-wide feasible approach to detect parent-of-origin effects in studies of quantitative traits.// Eur J Hum Genet. 2010;18(3):379-84. IF=4.5

• Aulchenko YS, Hoppenbrouwers IA, Ramagopalan SV, Broer L, Jafari N, Hillert J, Link J, Lundström W, Greiner E, Dessa Sadovnick A, Goossens D, Van Broeckhoven C, Del-Favero J, Ebers GC, Oostra BA, van Duijn CM, Hintzen RQ. Genetic variation in the KIF1B locus influences susceptibility to multiple sclerosis. Nat Genet. 2008;40(12):1402-3. IF=35

• Sokolova EA, Malkova NA, Korobko DS, Rozhdestvenskii AS, Kakulya AV, Khanokh EV, Delov RA, Platonov FA, Popova TY, Aref' eva EG, Zagorskaya NN, Alifirova VM, Titova MA, Smagina IV, El' chaninova SA, Popovtseva AV, Puzyrev VP, Kulakova OG, Tsareva EY, Favorova OO, Shchur SG, Lashch NY, Popova NF, Popova EV, Gusev EI, Boyko AN, Aulchenko YS, Filipenko ML. Association of SNPs of CD40 gene with multiple sclerosis in Russians.// PLoS One. 2013;8(4):e61032. IF=3.7

средний уровень исследований по стране IF 12,8

Дополнительные материалы

1) Проект Лота "03-03-12": [версия 2](https://drive.google.com/?tab=mo&authuser=0#folders/0B4qr4YB9sAfubU9QenZoMVlQYTg) 2) Номер предложения(й): [№: 1769](https://sstp.ru/fx/fcntp/ru.naumen.fcntp.components.jsp.published_jsp?uuid=corebofs000080000k5lrs7lgqa1gvs8)

Инициатор

Фаворова Ольга Олеговна [[адрес эл. почты скрыт]]

Ссылка

нет