НЖ1.2-03-03-08 Определение пространственной структуры биологических макромолекул

Постановка задачи

Исследования должны быть направлены на получение пространственных структур биологических макромолекул, представляющих интерес для решения проблем организации живой клетки, а также потенциально применимых для решения практически важных задач, в том числе: поиска новых фармакологических мишеней, создания терапевтических препаратов, конструирования биокатализаторов для биотехнологии. В качестве объектов исследования могут выступать индивидуальные макромолекулы (белки, нуклеиновые кислоты) и/или их комплексы. Исполнителям предлагается использовать следующие экспериментальные методы: рентгеноструктурный анализ, ЯМР-спектроскопия, малоугловое рентгеновское рассеяние, криоэлектронная микроскопия или их комбинации. Проекты, использующие исключительно методы численного моделирования пространственных структур биомакромолекул, не являются предметом данного конкурса. Структурная часть исследований должна быть проведена с использованием экспериментальных установок, находящихся на территории Российской Федерации. На один проект из средств федерального бюджета выделяется не менее 12 млн. руб. и не более 15 млн. руб. Не менее 10% от общей стоимости проекта должно обеспечиваться собственными или привлеченными денежными средствами (от 1,34 млн. до 1,67 млн руб.). **Будет поддержано не менее 8 проектов.**

Ожидаемый эффект

Выполнение каждого проекта должно обеспечить не менее 3 публикаций в международных научных журналах с импакт-фактором выше 2,5. По каждому проекту не менее одной пространственной структуры должно быть размещено в базе данных www.rcsb.org.

Публикации

  • Dror R.O., Green H.F., Valant C., Borhani D.W., Valcourt J.R., Pan A.C., Arlow D.H., Canals M., Lane J.R., Rahmani R., Baell J.B., Sexton P.M., Christopoulos A., Shaw D.E. Structural basis for modulation of a G-protein-coupled receptor by allosteric drugs // Nature -- IF 38.6
  • Wang C., Wu H., Katritch V., Han G.W., Huang X.P., Liu W., Siu F.Y., Roth B.L., Cherezov V., Stevens R.C. Structure of the human smoothened receptor bound to an antitumour agent // Nature -- IF 38.6
  • Boutet S., Lomb L., Williams G.J., Barends T.R., Aquila A., Doak R.B., Weierstall U., DePonte D.P., Steinbrener J., Shoeman R.L., Messerschmidt M., Barty A., White T.A., Kassemeyer S., Kirian R.A., Seibert M.M., Montanez P.A., Kenney C., Herbst R., Hart P., Pines J., Haller G., Gruner S.M., Philipp H.T., Tate M.W., Hromalik M., Koerner L.J., van Bakel N., Morse J., Ghonsalves W., Arnlund D., Bogan M.J., Caleman C., Fromme R., Hampton C.Y., Hunter M.S., Johansson L.C., Katona G., Kupitz C., Liang M., Martin A.V., Nass K., Redecke L., Stellato F., Timneanu N., Wang D., Zatsepin N.A., Schafer D., Defever J., Neutze R., Fromme P., Spence J.C., Chapman H.N., Schlichting I. High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography // Science -- IF 31.0
  • Seibert M.M., Ekeberg T., Maia F.R., Svenda M., Andreasson J., Jönsson O., Odić D., Iwan B., Rocker A., Westphal D., Hantke M., DePonte D.P., Barty A., Schulz J., Gumprecht L., Coppola N., Aquila A., Liang M., White T.A., Martin A., Caleman C., Stern S., Abergel C., Seltzer V., Claverie J.M., Bostedt C., Bozek J.D., Boutet S., Miahnahri A.A., Messerschmidt M., Krzywinski J., Williams G., Hodgson K.O., Bogan M.J., Hampton C.Y., Sierra R.G., Starodub D., Andersson I., Bajt S., Barthelmess M., Spence J.C., Fromme P., Weierstall U., Kirian R., Hunter M., Doak R.B., Marchesini S., Hau-Riege S.P., Frank M., Shoeman R.L., Lomb L., Epp S.W., Hartmann R., Rolles D., Rudenko A., Schmidt C., Foucar L., Kimmel N., Holl P., Rudek B., Erk B., Hömke A., Reich C., Pietschner D., Weidenspointner G., Strüder L., Hauser G., Gorke H., Ullrich J., Schlichting I., Herrmann S., Schaller G., Schopper F., Soltau H., Kühnel K.U., Andritschke R., Schröter C.D., Krasniqi F., Bott M., Schorb S., Rupp D., Adolph M., Gorkhover T., Hirsemann H., Potdevin G., Graafsma H., Nilsson B., Chapman H.N., Hajdu J. Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser // Nature -- IF- 38.6
  • Barends T.R., Foucar L., Botha S., Doak R.B., Shoeman R.L., Nass K., Koglin J.E., Williams G.J., Boutet S., Messerschmidt M., Schlichting I. De novo protein crystal structure determination from X-ray free-electron laser data // Nature -- IF 38.6

средний уровень исследований за рубежом: IF 37.1

Кто может участвовать в конкурсе?

1) Институт биохимии им. А.Н. Баха РАН (средний IF 10.8) (группа В.О. Попова)

2) Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН (средний IF – 14.1) (группа К.М. Полякова)

3) Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (средний IF 5.0) (группа А.С. Арсеньева)

4) Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова (средний IF 7.3) (группа к.х.н. О.С. Соколовой)

5) Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова РАН (средний IF 9.4) (группа М.В. Ковальчука)

6) НИЦ «Курчатовский институт» (средний IF – 4.0) (группа В.О. Попова)

7) Центр «Биоинженерия» РАН (средний IF – 2.5) (группа Н.В. Равина)

8) Институт белка РАН (средний IF – 10.7) (группа М.Б. Гарбер)

9) Московский физико-технический институт (средний IF – 3.4) (группа В.И. Горделия)

средний уровень исследований в стране: IF 8.0

Дополнительные материалы

1) Проект Лота "03-03-08": [версия 2](https://drive.google.com/?tab=mo&authuser=0#folders/0B4qr4YB9sAfuT2xfbGlHQXZzbm8) 2) Номер предложения(й): [№: 1693](https://sstp.ru/fx/fcntp/ru.naumen.fcntp.components.jsp.published_jsp?uuid=corebofs000080000k5hskogi9l26h60)

Инициатор

Долгих Дмитрий Александрович [[адрес эл. почты скрыт]] Константин Михалович Бойко [[адрес эл. почты скрыт]]

Ссылка

-

Предложите свои аргументы в пользу или против этого проекта

  • Один аргумент должен содержать один обосновывающий довод. Например, если Вас не устраивает (а) формулировка темы проекта, и (б) Вы считаете, что указанные публикации не имеют отношения к теме проекта, то это два отдельных аргумента «против».
  • Аргумент НЕ должен содержать: вопросы; мнение об аргументе другого участника; одобрение/неодобрение тематики по иным критериям, кроме того, что результаты можно опубликовать в высокорейтинговом журнале. Аргументы желательно подтверждать ссылками на статьи.

Аргументы ЗА 0

На данный момент аргументов нет

Аргументы ПРОТИВ 0

На данный момент аргументов нет