Проект принят, обсуждение закрыто.

НЖ1.2-13-01-02 Системы таргетного редактирования генома на основе направляющих нуклеиновых кислот

Постановка задачи

Исследования должны быть направлены на разработку новых способов редактирования генома клеток млекопитающих. Допускаются так же работы, направленные на повышение эффективности и модификации уже существующих способов. В качестве основы разработок необходимо уделить особое внимание системам транспорта функциональных молекул РНК. В работах необходимо использовать молекулы РНК, эффективность взаимодействия которых с сайт-специфическими нуклеазами подтверждена результатами исследований. Испытания разрабатываемых методов должны проводиться на клеточных линиях млекопитающих. Выполнение проекта позволит впоследствии внедрить в практику новые способы наследуемой модификации геномов млекопитающих, которые потенциально применимы во всех областях биоинженерии.

Количество проектов: 3
Бюджет одного проекта: 20 млн.руб. + 20% внебюджетные средства

**Сроки выполнения:** 24 месяца.

Ожидаемый эффект

Созданы патентно-защищенные или блокирующие технологии для таргетной модификации генома в клетках млекопитающих, реализованные в виде наборов реагентов или коммерциализуемых технологий (протоколов). Созданы клеточные линии с измененным с применением данной технологии генотипом и фенотипом.

Индустриальные партнеры.

ООО «Институт стволовых клеток человека» Работает в сфере создания новых технологий для терапии.

 ЗАО "Евроген" Российская инновационная биотехнологическая компания, основанная в 2000 г. Основные направления деятельности - научные исследования, разработка новых технологий и продуктов, выполнение заказов в области молекулярной биологии, биотехнологии и генной инженерии.

ООО «Скайджни» Предоставляет сервисные услуги в области современных молекулярных технологий.

ООО «Бигль» Сервисные услуги в области молекулярной биологии и генетической инженерии

Публикации

Kim, Kim (2014) A guide to genome engineering with programmable nucleases // Nat Rev Genet – IF-39.8

Carroll (2014) Genome engineering with targetable nucleases // Annu Rev Biochem – IF-27.7

Anders et al. (2014) Structural basis of PAM-dependent target DNA recognition by the Cas9 endonuclease // Nature – IF-42.4

Nishimasu et al. (2014) Crystal structure of Cas9 in complex with guide RNA and target DNA // Cell – IF-35.0

Wang et al. (2012) Correcting human mitochondrial mutations with targeted RNA import // PNAS – IF-9.7

Средний уровень исследований за рубежом: IF-30.9

Кто может участвовать в конкурсе?

1) Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук (средний IF-16.7)

Dolgova et al. (2013) Delivery and processing of exogenous double-stranded DNA in mouse CD34+ hematopoietic progenitor cells and their cell cycle changes upon combined treatment with cyclophosphamide and double-stranded DNA // Gene – IF-2.3

Alyamkina et al. (2010) A strategy of tumor treatment in mice with doxorubicin-cyclophosphamide combination based on dendritic cell activation by human double-stranded DNA preparation // Genet Vaccines Ther – IF-2.1

Alyamkina et al. (2010) Effect of double-stranded DNA on maturation of dendritic cells in vitro // Cell Immunol – IF-2.2

2) Биологический факультет Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова (средний IF-7.3)

Gulevich AV et al. (2011) Multicomponent synthesis of artificial nucleases and their RNase and DNase activity// Beilstein J Org Chem. 7- IF – 3.3

Comte et al. (2013) Mitochondrial targeting of recombinant RNAs modulates the level of a heteroplasmic mutation in human mitochondrial DNA associated with Kearns Sayre Syndrome // NAR – IF-8.2

Karicheva et al. (2011) Correction of the consequences of mitochondrial 3243A>G mutation in the MT-TL1 gene causing the MELAS syndrome by tRNA import into mitochondria // NAR – IF-8.2

Kolesnikova et al. (2010) Selection of RNA aptamers imported into yeast and human mitochondria // RNA – IF-5.5

3) Институт теоретической и экспериментальной биофизики (средний IF – 5,7)

Antipova VN et al. (2014) Ab initio DNA synthesis by Bst polymerase in the presence of nicking endonucleases Nt.AlwI, Nb.BbvCI, and Nb.BsmI. // FEMS Microbiol Lett. – IF-3.8.

Zheleznaya LA et al. (2009) Nicking endonucleases. // Biochemistry (Mosc). – IF -1.9

Zyrina NV et al. (2012) Effect of single-stranded DNA binding proteins on template/primer-independent DNA synthesis in the presence of nicking endonuclease Nt.BspD6I // Bioorg khim.– IF-0.9

4) Научный центр неврологии Российской академии медицинских наук (средний IF – 8.4)

Ponomareva et al. (2014) Alpha-theta border EEG abnormalities in preclinical Huntington's disease // J Neurol Sci – IF-1.0

Stelmashook et al. (2014) Role of zinc and copper ions in the pathogenetic mechanisms of Alzheimer's and Parkinson's diseases // Biochemistry (Mosc) – IF-1.3

Alieva et al. (2014) Involvement of endocytosis and alternative splicing in the formation of the pathological process in the early stages of Parkinson's disease // Biomed Res Int – IF-2.7

5) Институт биоорганической химии им. Шемякина и Овчинникова (средний IF-18.7)

Kurochkina LP et al (2012). Expression and functional characterization of the first bacteriophage-encoded chaperonin. // J Virol. – IF-7.2

Kim DY et al. (2014) Enhancement of protein expression by alphavirus replicons by designing self-replicating subgenomic RNAs. // PNAS – IF – 21.4

Atasheva S et al. (2014) Interferon-stimulated poly(ADP-Ribose) polymerases are potent inhibitors of cellular translation and virus replication // J Virol. – IF-7.2

Дополнительные материалы

Номера предложений: 3805, 2147, 2040

Инициатор

--

Ссылка

--