Проект принят, обсуждение закрыто.

Разработка комплектов наборов реагентов и расходных материалов для секвенирования и генетического типирования ДНК на основе отечественной платформы капиллярного электрофореза (4542)

Постановка задачи

  1. Разработать, зарегистрировать иобеспечить серийное производство наборов реагентов для секвенирования и генетического типирования ДНК, адаптированных для серийно-выпускаемых отечественных генетических анализаторов.
  2. Повысить эффективность молекулярно-генетической диагностики онкологических заболеваний и бактериальных инфекций.
  3. Обеспечить полное замещение импорта при идентификации личности, паспортизации основных видов сельскохозяйственных животных (свинья, КРС, лошадь) и сортов растений (пшеница, картофель, кукуруза).
  4. Обеспечить лаборатории средствами автоматизации для проведения экспресс-анализа с использованием разработанных наборов реагентов.

Ожидаемый эффект

Результатами проекта станут продукты – наборы реагентов и расходные материалы. 

Запуск промышленного производства разработанных наборов реагентов в 2018 году объемом не менее 10 тысяч наборов в год. Увеличение объемов производства по каждому виду наборов к 2021 году в 5 раз.

Коммерциализация продуктов в России и за рубежом.

Публикации

  1. O. A. Simonova, E. B. Kuznetsova, S. S. Stepanenkova, E. V. Poddubskaya, R. A.Kerimov, A.S. Tanas, V. V. Strelnikov, D. V. Zaletaev. Comprehensive analysis of abnormal methylation of the genes encoding extracellular matrix proteins in breast cancer. European J. Hum. Genet. 2014. v. 22, Sup. 1. р. 306-307.ИФ 4,225.
  2. Pérez-Losada M, Cabezas P, Castro-Nallar E, Crandall KA. Pathogen typing in the genomics era: MLST and the future of molecular epidemiology. // Infect Genet Evol. 2013 16:38-53. ИФ 3,015.
  3. Phillips C, Gelabert-Besada M, Fernandez-Formoso L, García-Magariños M, Santos C, Fondevila M, Ballard D, Syndercombe Court D, Carracedo A, Lareu MV. New turns from old STaRs: enhancing the capabilities of forensic short tandem repeat analysis. Electrophoresis. 2014 35(21-22):3173-87. ИФ 3,028.
  4. K.B. Ignatov, E.V. Barsova, A.F. Fradkov,K.A. Blagodatskikh, T.V. Kramarova, and V.M. Kramarov. A strong strand displacement activity of thermostable DNA polymerase markedly improves the results of DNA amplification //BioTechniques, 2014,57:81-87. ИФ 2,948.
  5. Reusch D, Haberger M, Kailich T, Heidenreich AK, Kampe M, Bulau P, Wuhrer M. High-throughput glycosylation analysis of therapeutic immunoglobulin G by capillary gel electrophoresis using a DNA analyzer. MAbs. 2014 Jan-Feb;6(1):185-96. ИФ 4,814.
  6. Rahman M. M., Elaissari A. Nucleic acid sample preparation for in vitro molecular diagnosis: from conventional techniques to biotechnology // Drug discovery today. – 2012. – Т. 17. – №. 21. – С. 1199-1207. ИФ 6,691.

Кто может участвовать в конкурсе?

НИИ онкологии им. Н.Н. Петрова МЗ РФ, г. СПб

Первый МГМУ им. И.М. Сеченова МЗ РФ

НИИ антимикробной химиотерапии СГМА МЗ РФ, г. Смоленск

ЦНИИ туберкулеза, г. Москва

ООО «Гордиз», г. Москва

РГАУ-ТСХА им. К.А.Тимирязева, г. Москва

НГУ, г. Новосибирск

Институт биоорганической химии РАН, г. Москва

Институт аналитического приборостроения РАН, г. СПб.

Экспериментальный завод РАН, г. Черноголовка

Дополнительные материалы

Работа будет проводиться по пяти подпроектам:

1) Разработка комплекса исследовательских и диагностических протоколов для диагностики онкологических заболеваний. Будут разработаны системы маркеров аномального метилирования и наборы реагентов для диагностики и прогноза рака молочной железы, простаты, шейки матки, эндометрия, для выявления мутаций ДНК в опухолях и полиморфизмов, ассоциированных с повышением риска развития опухолей.

2) Разработка комплекса исследовательских и диагностических протоколов для диагностики бактериальных заболеваний. Будут созданы наборы для внутривидового типирования возбудителей нозокомиальных инфекций на основе методов мультилокусного секвенирования-типирования; наборы для определения лекарственной чувствительности, видовой идентификации и внутривидового типирования микобактерий.

3) Разработка комплекса исследовательских и диагностических протоколов для ДНК-идентификации человека, паспортизации пород животных и видов растений. Будут созданы наборы для идентификации личности с 7-ми канальной детекцией по 28 локусам ДНК человека, для паспортизации видов сельскохозяйственных животных(свинья, КРС, лошадь) и сортов растений (пшеница, картофель, кукуруза) с 7-ми канальной детекцией по 15 локусам для каждого объекта.

4) Разработка комплектов наборов реагентов и расходных материалов для секвенирования ДНК и профилирования гликанов. Будут созданы наборы для секвенирования ДНК по Сэнгеру, реагенты для автоматизированной очистки реакционных смесей перед КЭФ, рекомбинантная PNGase F и наборы реагентов для выделения гликанов и коньюгации с флуорофором.

5) Разработка картриджа и прибора для экспресс выделения и амплификации нуклеиновых кислот. Будут созданы одноразовый картридж с реагентами, обеспечивающий выделение нуклеиновых кислот и амплификацию заданных мишеней для дальнейшего анализа методом капиллярного электрофореза; автоматический прибор для обработки 4-х образцов одновременно за 60 минут.

Инициатор

ВНИИ сельскохозяйственной биотехнологии, г. Москва

Индустриальный партнер – ЗАО «Синтол», г. Москва.

Ссылка